小耳畸形的病因目前還不完全明確，環(huán)境和遺傳因素是目前小耳畸形病因研究的重點(diǎn)。先天性小耳畸形在基因突變致病性研究方面還沒(méi)有闡明小耳畸形胚胎發(fā)育的機(jī)制。小耳畸形主要涉及胚胎發(fā)育期間第一和第二鰓弓的異常，主要表型涉及外耳發(fā)育異常。外耳的耳廓是由第一和第二鰓弓的逐漸融合形成的，在發(fā)育過(guò)程中第一和第二鰓弓之間是相互作用，兩弓之間的凹槽加深，形成外耳道，從胚胎的起源來(lái)分析，外耳的發(fā)育至少在一定程度上是由第一和第二鰓弓通過(guò)后腦的部分區(qū)域來(lái)介導(dǎo)的，后腦是鰓弓的神經(jīng)嵴細(xì)胞的來(lái)源，在后腦的第四段基因突變可以導(dǎo)致外耳的發(fā)育缺陷。

小耳畸形主要是指外耳的先天發(fā)育性結(jié)構(gòu)異常，其嚴(yán)重程度主要表現(xiàn)為從輕度結(jié)構(gòu)異常到完全性耳廓缺失，并且可伴有外耳道狹窄和外耳道閉鎖等一系列先天性外耳異常，輕者耳廓略小于正常， 畸形嚴(yán)重者耳廓全部消失， 絕大多數(shù)患者僅遺留花生狀或貝殼狀的殘耳組織。同時(shí)一些小耳畸形患者也常合并顱面部畸形，中耳及半側(cè)顏面骨及軟組織發(fā)育不良等。

Prkra 小耳小鼠屬于自發(fā)性突變,純合型小鼠在2 周齡時(shí)即可見(jiàn)耳廓較小,身長(zhǎng)尺寸比正常稍小。純合型小鼠生長(zhǎng)速度比雜合型或野生型同窩小鼠慢,成熟后不能生育,所以該品系主要靠雜合子與雜合子交配來(lái)繁育,獲得實(shí)驗(yàn)所需的純合型小鼠。Prkra 小耳小鼠突變位點(diǎn)為在2 號(hào)染色體76、643、218 bp(GRCm38)上的G向A 的突變轉(zhuǎn)換,位于第3 外顯子之后,這可能會(huì)影響前體pre-mRNA 的剪接。